3 hovedeksempler på transposons (427 ord)
De tre viktigste eksemplene på transposoner er som følger:
1. Tn 3 transposon av E. coli:
Den molekylære strukturen av transposon Tn3 av E. coli er blitt utarbeidet (figur 41.4). Tn 3 har 4957 bp og inneholder tre gener som tnp A, tnp R og bla, som koder for henholdsvis følgende proteiner: 1. transposase som har 1015 aminosyrer og er nødvendig for transponering; 2. en repressor (også kalt resolvase) som inneholder 185 aminosyrer som regulerer transposasen; og 3. β-laktamase enzym som gir resistens mot antibiotikum ampicillin. På begge sider av Tn 3 er en omvendt gjentagelse på ca 38 bp.
2. Bakteriofag Mu:
Bakteriofagen Mu (.Mu = mutator) er en temperert bakteriofag som har typiske fagegenskaper og kan betraktes som en gigantisk transposon. Phage Mu ble ansett å oppføre seg på en unik måte siden den ikke forminerer på en lytisk måte. Den starter alltid sin livssyklus ved å sette seg inn i E. coli kromosomet på tilfeldige steder. Den resulterende profagen muterer ofte generene som de blir satt inn i (figur 41.5). Fag Mu var således opprinnelig kjent for dets mutagene egenskaper.
Image Courtesy: upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/9/99/Transposons.jpg
Under senere del av faglivssyklusen genererer Mu-profasen på en eller annen måte sin transponering, men aktiverer også gener som koder for strukturelle proteiner som pakker dets DNA. Mu fag er også unik i transponering ofte enn andre transposoner, og gir nesten hundre nye kopier av Mu i løpet av sin times lange livssyklus.
Som andre transposoner har Mu phage inverterte gjentagelser (IR) ved eller i nærheten av endene av dets DNA, og det gjør en kort duplisering med 5 basepar av det bakterielle DNA som det settes inn i.
3. Gjær Ty elementer:
Gjær-Saccharomyces cerevisiae bærer ca. 35 kopier av et transponerbart element kalt Ty i sitt haploidgenom. Disse transposonene er ca. 5900 basepar lange og er begrenset i hver ende av et DNA-segment kalt delta-8-sekvensen, som er ca. 340 basepar lange.
Hver 8 sekvens er orientert i samme retning, og danner det som er kjent som direkte lange terminale repetisjoner eller LTRs. Ty-elementene flankeres av fem baseparre direkte gjentagelser opprettet ved duplisering av DNA på stedet for Ty-innføringen. Disse duplikasjonene på målstedet er funnet rikt på AT-basepar. Gjær Ty-elementer kalles noen ganger retrotransposoner på grunn av deres generelle likhet med retrovirusene.
I likhet med gjæren finnes i andre eukaryoter som Zea Mays, Drosophila, mus og snapdragons (Antirrhinum majus) transponeringselementer av en eller annen type.
