Binding av en anibody med sin epitop
Binding av et antistoff med sin epitop!
Molekylene av en bestemt epitop og molekylene av antigenbindingsstedet for antistoff (dannet mot den spesielle epitopen) er komplementære til hverandre.
Antigenbindingsstedet (av et antistoff) danner en konturoverflate som støper tett på overflaten av epitopen. Epitopen og antistoffet passer sammen i et "lock-and-key" forhold (figur 6.3).
Epitopen som et bestemt antistoff binder, avhenger av konformasjonen av epitopen. Antistoffet binder seg ikke til en epitop med en annen konformasjon, dvs. at antistoffet dannet mot en bestemt epitop vil kombinere med den bestemte epitopen, noe som førte til dannelsen, men ikke med andre epitoper. Dette refereres til som spesifisiteten av antistoffet).
Bindingen av et antistoff med epitopen avhenger av mange faktorer:
en. Kjemisk karakter av epitop og antigenbindingssted (individuelle aminosyrer av epitopen og aminosyrene i antistoffet er plassert på en slik måte at det muliggjør dannelse av binding mellom positive og negativt ladede rester på epitop og antigenbindingssted for antistoff).
b. Hydrogenbindinger
c. Van der Waals kontakt, og
d. Lokaliserte hydrofobiske interaksjoner mellom de to flater.
Antistoffet dannet mot en epitop vil bare binde til epitopen mot hvilken det ble indusert. Mutasjon i et gen som koder for en epitop, vil føre til en forandring i aminosyresekvensen til epitopen. Enhver endring i aminosyresekvensen av epitopen resulterer i en endring i epitopens konformasjon. Følgelig dannes en ny epitop av et mutert gen og den nye epitopen er forskjellig fra den tidligere epitopen.
Derfor vil antistoffet dannet mot den tidligere epitopen ikke binde seg til den nye epitopen dannet etter mutasjon. Dette fenomenet har store konsekvenser som for enkelte humane infeksjoner (som human immunodeficiency virus) er opptatt av. Etter en virusinfeksjon dannes antistoffer mot virusepitoper. Disse antistoffene binder til bestemte virusepitoper på virus og fører til viral eliminering.
Hvis viruset muterer, vil de nye virale epitoper dannet etter mutasjon være forskjellig fra den tidligere epitopen. Følgelig blir antistoffer dannet mot tidligere epitop ubrukelig, da antistoffene ikke kan binde og eliminere viruset. Dermed unnslipper viruset fra immunforsvaret og fortsetter å forårsake sykdom.
Et antistoff kombinerer bare med epitopen av et immunogen mot hvilket det ble indusert. Tenk deg at et immunogen har en epitop som heter A. Antistoffene dannet mot epitopen A vil bare binde til epitop A. Hvis det er et annet immunogen, som har en epitop som ligner epitopen A av det første immunogenet, kan antistoffet kombinere med andre immunogen også. Dette kalles kryssreaksjon. Generelt har antistoff en lavere affinitet for et kryssreagerende antigen enn for det opprinnelige (eller kognitive) antigenet mot hvilket det ble indusert.
