Holoenzyme-komponenter: (1) Kjernenzymet og (2) Sigma-faktoren

Den fullverdige RNA-polymerase fra E. coli er kjent som holoenzymet. Holoenzymet består av følgende to komponenter: (1) kjernenzymet og (2) sigmafaktoren. Holoenzymet kan symboliseres som a ₂ β β 'σ. !

1. Kjernenzymet:

Kjernenzymet kan ikke initiere transkripsjon på de riktige stedene, men det kan syntetisere RNA ved hjelp av DNA som en mal.

Kjerne-RNA-polymerasen består av fire polypeptider som har følgende tre typer:

(a) a-underenheten:

Det er tilstede i to kopi / kjerne enzym molekyl, og er opptatt av binding med promotor DNA. Den eksakte mekanismen for dens binding med DNA er ukjent.

(b) P-underenheten:

Det er tilstede i et enkeltkopi / enzymmolekyl, og er involvert i binding med de innkommende nukleotidene for RNA-syntese. Anerkjennelsen av de riktige nukleotidene motsatte DNA-baser ser ut til å være basert på deres generelle geometri i forhold til hverandre, snarere på parringsadferdene til baser.

(c) P-underenheten:

Det er involvert i binding med mal-DNA, dvs. den enkeltstrengede DNA-strengen genereres for å tillate transkripsjonen å fortsette.

Hver underenhet bidrar til funksjonen av kjernenzymet som helhet, som bør ha minst følgende fire forskjellige funksjonssteder.

(i) Et DNA-avviklingssted som holder avviklingen av DNA-duplekset når kjernenzymet beveger en base om gangen langs DNA'et som transkriberes.

(ii) Nettstedet binder til "antisense streng", strengen som transkriberes.

(iii) Et annet nettsted binder seg til "sense streng", strengen komplementæren lo antisense streng, av DNA som transkriberes.

(iv) Et DNA-tilbakekallingssted er opptatt av å spole de to strengene av DNA til en normal dupleks.

2. Sigma-faktoren:

Sigma-faktoren er involvert i stabil binding av RNA-polymerasen til promotor-DNA'et; og muligens med transkripsjonsinitiering. Det er ikke involvert i transkripsjonen i seg selv (dvs. RNA-syntese) som den blir utgitt når RNA-kjeden når 8-9 baser; kjernenzymet fortsetter deretter transkripsjon.

RNA-polymerase i eukaryoter:

Alle eukaryoter har tre forskjellige klasser av RNA-polymerase, kalt RNA-polymerase I, RNA-polymerase II og RNA-polymerase III.

RNA-polymerase I:

Dette enzymet er lokalisert i nukleolus og er ansvarlig for transkripsjonen av ribosomal RNA.

RNA-polymerase II:

Denne polymerasen er lokalisert i nukleoplasmaet som er en del av kjernen bortsett fra nukleolus. Dette enzymet er den viktigste komponenten av RNA-polymeraseaktivitet, og den transkriberer alle gener som produserer mRNA. I eukaryoter er transkriptet i utgangspunktet i form av mRNA-forløpere, kalt heterogent nukleært RNA (hn RNA) som senere behandles til mRNA.

RNA polymerase III:

Dette enzymet forekommer i nukleoplasma og transkriberer tRNA- og 5S-RNA-gener.

Organellar RNA-polymerase:

I tillegg til de kjernefysiske RNA-polymerasene I, II og III har eukaryote celler en liten mengde RNA-polymeraseaktivitet i deres organeller, dvs. mitokondrier og plastider. Disse polymeraser er nødvendige for å transkribere relativt få gener som er tilstede i disse organeller. Disse enzymene ser ut til å være analoge med fag-RNA-polymeraser.