Nyttige notater om epitop av immunogener

Nyttige notater om Epitop av Immunogener!

De fleste immunogener består av mange typer molekyler.

Imidlertid virker bare få av disse molekylene som immunogen. Selv innenfor et enkelt immunogent molekyl, er immunresponsen ikke rettet mot hele molekylet, men bare mot noen få aminosyrerester i molekylet.

Settet av aminosyrer som er gjenkjent av immunglobulin eller T-celle-reseptoren (TCR) kalles en epitop (tidligere kalt en antigen determinant). Et enkelt immunogent molekyl kan ha en eller flere forskjellige epitopper (figur 6.1).

Fig. 6.1: Diagram for å vise tilstedeværelsen av forskjellige epitoper i et antigen.

I dette diagrammet er tre forskjellige epitoper vist i et antigen. Peptidepitoperene adskiller seg fra hverandre av aminosyresekvenser, og de varierer følgelig i deres tredimensjonale struktur. Siden epitoper avviger fra hverandre, adskiller antistoffene indusert mot epitoperene også seg. Overflateimmunoglobulinet (slg; B-celle-reseptor) på en B-celle binder til en epitop, og bindingen skjer mellom epitopaminosyrene og de komplementære aminosyresekvensene i den hypervariable regionen av slg.

Aminosyrerester av protein har en tendens til å brette seg inn i kompakte masser. Det samlede foldemønsteret for hvert protein er stivt. Så de aminosyrerester som er eksponert på overflaten av den foldede massen, okkuperer faste steder i forhold til hverandre. Røntgenkrystallogrammer har vist at antistoffer kommer i kontakt med aminosyrerester på overflaten av et proteinantigen. Antallet aminosyrer som hver antistoffkontakt varierer fra 3-20.

Jeg. I mange tilfeller ligger alle aminosyrerester av en epitop lineært. Slike epitoper kalles lineære (eller sekvensielle) epitoper. Varmedaturering endrer ikke stillingene til resterne i en lineær epitop. Derfor, selv etter oppvarming, kombineres de lineære epitoper med deres tilsvarende antistoffer (figur 6.2).

ii. Mens noen epitoper ikke dannes av lineære aminosyrer. På grunn av den foldende naturen av aminosyrekjeden kommer aminosyrene fra forskjellige steder av kjeden nærmere hverandre. En epitop kan dannes av aminosyrer fra forskjellige deler av polypeptidkjeden og ligger nær hverandre. Denne typen epitop kalles konformasjons epitop.

Aminosyrerester som utgjør konformasjonsepitopen er langt fra hverandre i den primære aminosyresekvensen, men ligger nær hverandre i den tertiære strukturen. Når et protein med konformasjonsepitop oppvarmes, oppstår denaturering av proteinkjeden og aminosyrekjeden mister den tredimensjonale foldingen. Aminosyrene, som dannet epitopen, skilles fra hverandre på grunn av varme og følgelig går epitopen bort. Derfor kan antistoffene dannet mot konformasjonsepitopen ikke binde til det denaturerte antigenet (figur 6.2).