Virus: Klassifisering av virus (Adansonial & Nomenclature)

Virus: Klassifisering av virus!

Det er to generelle måter hvor virus kan klassifiseres. Den ene er det klassiske monotetiske hierarkiske systemet som Linné bruker til planter og dyr. Dette er et logisk system der divisjoner gjøres om den relative betydningen av forskjellige egenskaper som deretter brukes til å plassere et taxon i en bestemt fylum, orden, familie, slekt etc. Et alternativt system ble foreslått av Adanson (1763).

Image Courtesy: guardianlv.com/wp-content/uploads/2013/11/cholera-virus-or-bacteria-nhbn3b8t.jpg

Han foreslo at all kjent informasjon skal brukes og at alle tegn skal betraktes like viktig. Det er for tiden forslag og forutsetninger for begge disse tilnærmingene til virusklassifisering (Lwoff 1967, Gibbs og Harrison, 1968).

Lwoff et al. (1962) foreslo et system hvor typen nukleinsyre i partikkelen (DNA eller RNA) arkitekturen og symmetrien av viruspartiklene, nærvær eller fravær av en konvolutt, antall morfologiske underenheter (inikosahedral virus ), eller diameteren av stavformede virus ble ansett som de mest kompetente tegnene (i synkende rekkefølge) ved å lage store underoppdelinger. Deres system ble støttet i forslagene og anbefalingene fra den foreløpige komiteen for nomenklaturen for ulike grupperinger ned til familienivå for de tre første gruppene.

Klassifisering av virus

1. Adansonial klassifisering:

Adanson (1763), ansett at taxa ble best avledet ved å vurdere alle tilgjengelige tegn og gi like vekt til hver. Metoden er labourious og har ikke vært mye brukt til nylig. Tilgang til datamaskin har fornyet interesse for denne typen klassifisering.

2. Nomenklatur:

En av hovedgrunnene til at et latinsk binomialsystem for nomenklatur for virus er upassende for øyeblikket er at slike navn forsøker å gi både en etikett og noe informasjon om viruset som er merket. I den nåværende fasen av kunnskap eller mangel på det for de fleste virus, vil slike navn bli funnet å kreve endring ofte i fremtiden.

I et forsøk på å overvinne dette problemet har Gibbs og hans kollegaer (Gibbs et al., 1966, Gibbs og Harrison, 1968) foreslått et todelt system hvor den første delen av virusnavnet er en uendret etikett (dagens vernacularnavn) og den andre er en kodifisert informasjonsbutikk som lett kan adopteres og endres ettersom fakta akkumulerer om virusene. Hvert virus består av fire par symboler som følger:

1. par - Nukleinsyre / Nukleinsyre.

2. par - Molekylvekt av nukleinsyre / Prosent av nukleinsyre i infektiv partikkel.

3. par - Utsikt over partikkel / Utsikt over nukleokapsid.

4. par - Typer vertsinfisert / Typer av vektor.

For eksempel, tobaksmosaikkvirus (R / 1: 2/5: E / E: S *)